Table 3 Hunter Gaston Discriminatory Index (HGDI) of each locus of Multiple Loci VNTR Analysis (MLVA) for the whole sample and for the two major families
From: A first assessment of the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis complex in Cambodia
ETRA | ETRB | ETRC | ETRD | ETRE | MIRU02 | MIRU10 | MIRU16 | MIRU20 | MIRU23 | MIRU24 | MIRU26 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Total | 0,67 | 0,68 | 0,14 | 0,79 | 0,40 | 0,04 | 0,62 | 0,57 | 0,06 | 0,27 | 0,49 | 0,52 |
EAI | 0,73 | 0,56 | 0,23 | 0,73 | 0,38 | 0,03 | 0,24 | 0,18 | 0,06 | 0,38 | 0,03 | 0,03 |
Beijing | 0,07 | 0,00 | 0,00 | 0,13 | 0,13 | 0,00 | 0,51 | 0,50 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 0,37 |
MIRU27 | MIRU39 | MIRU40 | Mtub04 | Mtub21 | Mtub29 | Mtub30 | Mtub34 | Mtub39 | Qub11b | Qub26 | Qub4156 | |
Total | 0,27 | 0,24 | 0,38 | 0,60 | 0,65 | 0,47 | 0,41 | 0,02 | 0,77 | 0,62 | 0,69 | 0,45 |
EAI | 0,18 | 0,12 | 0,30 | 0,25 | 0,62 | 0,03 | 0,00 | 0,00 | 0,66 | 0,30 | 0,53 | 0,03 |
Beijing | 0,33 | 0,30 | 0,34 | 0,47 | 0,45 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 0,13 | 0,40 | 0,59 | 0,28 |